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士林區於明永曆年間,據荷蘭戶口表,設有毛少翁社、瓦笠社。清康熙年間設麻少翁社。乾隆五年,隸淡水海防廳淡水保八芝蓮林莊、瓦笠莊。乾隆十一年莊名為八芝蓮林莊、瓦笠莊。乾隆二十五年,隸淡水廳芝蘭一堡。同治年間,隸淡水廳淡水堡石角莊、八芝蘭林莊、瓦笠莊及番社毛紹翁社,另置八芝蘭街。嘉慶年間,隸淡水廳芝蘭一堡。同治年間,隸淡水廳石角溝莊、芝蘭街、毛少翁社莊和番社毛少翁社及大加臘堡溪州底莊、溪沙尾莊。光緒五年,隸臺北府淡水縣大加臘堡溪州底莊、溪沙尾莊、芝蘭一堡林口莊、員山子莊、福德洋莊、棋林厝莊、社子莊、洲尾莊、石角莊、南雅莊、三角埔莊、東勢莊、番仔莊、莊子頂莊、草山莊、公館地莊、菁碧莊、雙溪莊、番仔嶺莊、平頂莊、毛少翁社莊及芝蘭二堡中洲莊、溪洲莊。光緒十三年隸臺灣省臺北府淡水縣芝蘭一堡,莊名不變。光緒二十年仍如其舊。
日據後,屬臺北縣直轄。光緒二十三年台北縣士林辦務署。光緒二十四年隸臺北縣臺北辦務署。光緒二十七年隸臺北廳士林支廳。宣統元年,隸臺北廳士林支廳士林區、社子區。和尚洲區芝蘭一堡勢林街,林仔口莊、福德洋莊、湳雅莊、石角莊、洲尾莊、三角埔莊、下東勢莊、公館地莊、永福莊、雙溪莊、埤頂莊、菁礐莊、草山莊、七股莊;社子莊、溪洲底莊;中洲莊。民國九年隸臺北州七星郡士林莊。民國二十二年隸臺北州七星郡士林街。
光復後,民國三十五年五月一日隸臺北縣七星區士林鎮。次年一月隸臺北縣淡水區士林鎮。民國三十八年八月隸草山管理區士林鎮。民國三十九年四月隸陽明山管理局士林鎮。民國五十七年隸臺北市士林區,惟仍屬陽明山管理局轄下。民國六十六年元月一日陽明山管理局裁撤,直隸臺北市政府管轄。